Changes

              
    

          
          
        
        

            
f
1
{
f
1
{
            
2
  "author": "", 
2
  "author": "", 
            
3
  "author_email": "", 
3
  "author_email": "", 
            
4
  "creator_user_id": "2e9fa41b-0394-4070-98d0-205f79d5738b", 
4
  "creator_user_id": "2e9fa41b-0394-4070-98d0-205f79d5738b", 
            
5
  "extras": [
5
  "extras": [
            
6
    {
6
    {
            
7
      "key": "Data Management", 
7
      "key": "Data Management", 
            
8
      "value": "\"Biodiversity data standards From the very beginning, 
8
      "value": "\"Biodiversity data standards From the very beginning, 
            
9
OBIS has championed the use international standards for biogeographic 
9
OBIS has championed the use international standards for biogeographic 
            
10
data. Without agreement on the application of standards and protocols, 
10
data. Without agreement on the application of standards and protocols, 
            
11
OBIS would not have been able to build a large central database. OBIS 
11
OBIS would not have been able to build a large central database. OBIS 
            
12
uses the following standards:  Darwin Core Ecological Metadata 
12
uses the following standards:  Darwin Core Ecological Metadata 
            
13
Language Darwin Core Archive and dataset structure  Data publication 
13
Language Darwin Core Archive and dataset structure  Data publication 
            
14
and sharing OBIS nodes can accept any data files from its data sources 
14
and sharing OBIS nodes can accept any data files from its data sources 
            
15
or data providers, and they publish these data on their OBIS nodes 
15
or data providers, and they publish these data on their OBIS nodes 
            
16
IPT, which are harvested by central OBIS. The Integrated Publishing 
16
IPT, which are harvested by central OBIS. The Integrated Publishing 
            
17
Toolkit (IPT) is developed and maintained by the Global Biodiversity 
17
Toolkit (IPT) is developed and maintained by the Global Biodiversity 
            
18
Information Facility (GBIF). GBIF maintains an IPT manual. See here 
18
Information Facility (GBIF). GBIF maintains an IPT manual. See here 
            
19
for specific OBIS instructions:  IPT  OBIS data quality control 
19
for specific OBIS instructions:  IPT  OBIS data quality control 
            
20
procedures OBIS ignores records that do not meet a number of 
20
procedures OBIS ignores records that do not meet a number of 
            
21
standards. For example, all species names need to be matched against 
21
standards. For example, all species names need to be matched against 
            
22
an authoritative taxonomic register, such as the World Register of 
22
an authoritative taxonomic register, such as the World Register of 
            
23
Marine Species. In addition, quality is checked against the OBIS 
23
Marine Species. In addition, quality is checked against the OBIS 
            
24
required fields as well as against any impossible values. OBIS checks, 
24
required fields as well as against any impossible values. OBIS checks, 
            
25
rejects and reports the data quality back to the OBIS nodes, but never 
25
rejects and reports the data quality back to the OBIS nodes, but never 
            
26
change records. The OBIS tier 2 nodes are responsible for the data 
26
change records. The OBIS tier 2 nodes are responsible for the data 
            
27
quality and communicate errors back to the data providers. A number of 
27
quality and communicate errors back to the data providers. A number of 
            
28
QC tools are developed to help data providers and OBIS nodes:  QC tool 
28
QC tools are developed to help data providers and OBIS nodes:  QC tool 
            
29
for species names QC tool for geography and data format\""
29
for species names QC tool for geography and data format\""
            
30
    }, 
30
    }, 
            
31
    {
31
    {
            
32
      "key": "Data Policy", 
32
      "key": "Data Policy", 
            
33
      "value": "\"Guidelines on the sharing and use of data in OBIS 
33
      "value": "\"Guidelines on the sharing and use of data in OBIS 
            
34
Adopted at SG-OBIS-IV (Feb 2015) and IODE-XXIII (March 2015).  The 
34
Adopted at SG-OBIS-IV (Feb 2015) and IODE-XXIII (March 2015).  The 
            
35
OBIS data policy is based on the principles of timely, free and 
35
OBIS data policy is based on the principles of timely, free and 
            
36
unrestricted access to biodiversity data for the benefit of science 
36
unrestricted access to biodiversity data for the benefit of science 
            
37
and society, as defined in the:  IOC data exchange policy IOC 
37
and society, as defined in the:  IOC data exchange policy IOC 
            
38
guidelines on transfer of marine technology IODE objectives OBIS 
38
guidelines on transfer of marine technology IODE objectives OBIS 
            
39
vision and mission Unless data are collected through activities funded 
39
vision and mission Unless data are collected through activities funded 
            
40
by IOC/IODE, neither UNESCO, IOC, IODE, the OBIS Secretariat, nor its 
40
by IOC/IODE, neither UNESCO, IOC, IODE, the OBIS Secretariat, nor its 
            
41
employees or contractors, own the data in OBIS and they take no 
41
employees or contractors, own the data in OBIS and they take no 
            
42
responsibility for the quality of data or products based on OBIS, or 
42
responsibility for the quality of data or products based on OBIS, or 
            
43
the use or misuse that people may make of them nor can it control or 
43
the use or misuse that people may make of them nor can it control or 
            
44
limit the use of any data or products accessible through its website, 
44
limit the use of any data or products accessible through its website, 
            
45
other than through the use of a published Data Sharing and Use Terms 
45
other than through the use of a published Data Sharing and Use Terms 
            
46
and Conditions.  Data sharing agreement The data providers retain all 
46
and Conditions.  Data sharing agreement The data providers retain all 
            
47
rights and responsibilities associated with the data they make 
47
rights and responsibilities associated with the data they make 
            
48
available to OBIS via the OBIS nodes. The OBIS nodes warrant that they 
48
available to OBIS via the OBIS nodes. The OBIS nodes warrant that they 
            
49
have made the necessary agreements with the original data providers 
49
have made the necessary agreements with the original data providers 
            
50
that it can make the data available to OBIS data under the following 
50
that it can make the data available to OBIS data under the following 
            
51
Creative Commons licenses:  CC-0 CC-BY CC-BY-NC CC-0 is the preferred 
51
Creative Commons licenses:  CC-0 CC-BY CC-BY-NC CC-0 is the preferred 
            
52
one and CC-BY-NC the least preferred.  The data providers are 
52
one and CC-BY-NC the least preferred.  The data providers are 
            
53
responsible for the completeness of the data and metadata profiles. 
53
responsible for the completeness of the data and metadata profiles. 
            
54
When data is made available to OBIS, OBIS is granted permission to:  
54
When data is made available to OBIS, OBIS is granted permission to:  
            
55
Distribute the data via its data and information portal Build an 
55
Distribute the data via its data and information portal Build an 
            
56
integrated database, use the data for data quality control purposes, 
56
integrated database, use the data for data quality control purposes, 
            
57
complement the data with other data such as climate variables and 
57
complement the data with other data such as climate variables and 
            
58
build value-added information products and services for science and 
58
build value-added information products and services for science and 
            
59
decision-making Serve the data to other similar open-access networks 
59
decision-making Serve the data to other similar open-access networks 
            
60
such as GBIF in compliance with the terms and conditions for use set 
60
such as GBIF in compliance with the terms and conditions for use set 
            
61
by the data providers. In pursuance of copyright compliance, OBIS 
61
by the data providers. In pursuance of copyright compliance, OBIS 
            
62
endeavours to secure permission from rights holders to ingest their 
62
endeavours to secure permission from rights holders to ingest their 
            
63
datasets. In the event that the inclusion of a dataset in OBIS is 
63
datasets. In the event that the inclusion of a dataset in OBIS is 
            
64
challenged on the basis of copyright infringement, OBIS will follow a 
64
challenged on the basis of copyright infringement, OBIS will follow a 
            
65
take-down policy until there is resolution.  Data use agreement The 
65
take-down policy until there is resolution.  Data use agreement The 
            
66
data in OBIS are freely available to everyone, following the 
66
data in OBIS are freely available to everyone, following the 
            
67
principles of equitable access and benefit sharing and supporting 
67
principles of equitable access and benefit sharing and supporting 
            
68
capacity development and participation of all IOC Member States in 
68
capacity development and participation of all IOC Member States in 
            
69
global programmes. However, data users are expected to give 
69
global programmes. However, data users are expected to give 
            
70
attribution to the data providers (see Citations) and the use of data 
70
attribution to the data providers (see Citations) and the use of data 
            
71
from OBIS should happen in the light of fair use, i.e.:  Recognize 
71
from OBIS should happen in the light of fair use, i.e.:  Recognize 
            
72
that the OBIS portal holds the master copy of the integrated database 
72
that the OBIS portal holds the master copy of the integrated database 
            
73
and hence users should refrain from online redistribution of the OBIS 
73
and hence users should refrain from online redistribution of the OBIS 
            
74
database. Because the OBIS database is updated regularly (every so 
74
database. Because the OBIS database is updated regularly (every so 
            
75
months) with new datasets and revisions of existing datasets, copies 
75
months) with new datasets and revisions of existing datasets, copies 
            
76
of the OBIS database will become out of date quickly. If you wish to 
76
of the OBIS database will become out of date quickly. If you wish to 
            
77
build access web services on top of OBIS, please contact the OBIS 
77
build access web services on top of OBIS, please contact the OBIS 
            
78
secretariat. Respect the data providers, and provide helpful feedback 
78
secretariat. Respect the data providers, and provide helpful feedback 
            
79
on data quality. In the case you are a custodian of biogeographic data 
79
on data quality. In the case you are a custodian of biogeographic data 
            
80
yourself you should take action to also publish these data through 
80
yourself you should take action to also publish these data through 
            
81
OBIS. Consider sponsoring or partnering with OBIS and its OBIS nodes 
81
OBIS. Consider sponsoring or partnering with OBIS and its OBIS nodes 
            
82
in grant proposal writing. Creating a global database like OBIS cannot 
82
in grant proposal writing. Creating a global database like OBIS cannot 
            
83
happen without the, often voluntary, contribution of many scientists 
83
happen without the, often voluntary, contribution of many scientists 
            
84
and data managers all over the world. Several activities, such as the 
84
and data managers all over the world. Several activities, such as the 
            
85
coordination, data aggregation, quality control, database and website 
85
coordination, data aggregation, quality control, database and website 
            
86
maintenance require resources including manpower at national and 
86
maintenance require resources including manpower at national and 
            
87
international level. A list of sponsors can be found here\""
87
international level. A list of sponsors can be found here\""
            
88
    }, 
88
    }, 
            
89
    {
89
    {
            
90
      "key": "Data Sharing Principle", 
90
      "key": "Data Sharing Principle", 
            
91
      "value": "\"OBIS harvests occurrence records from thousands of 
91
      "value": "\"OBIS harvests occurrence records from thousands of 
            
92
datasets and makes them available as a single integrated dataset. 
92
datasets and makes them available as a single integrated dataset. 
            
93
There are several ways to access OBIS data:  The mapper allows users 
93
There are several ways to access OBIS data:  The mapper allows users 
            
94
to visualize and inspect subsets of OBIS data. A variety of filters 
94
to visualize and inspect subsets of OBIS data. A variety of filters 
            
95
(taxonomic, geographic, time, data quality) is available and multiple 
95
(taxonomic, geographic, time, data quality) is available and multiple 
            
96
layers can be combined in a single view. Layers can be downloaded as 
96
layers can be combined in a single view. Layers can be downloaded as 
            
97
CSV files. Our R package provides direct access to the OBIS database 
97
CSV files. Our R package provides direct access to the OBIS database 
            
98
from R. Both the mapper and the R package are based on the OBIS API 
98
from R. Both the mapper and the R package are based on the OBIS API 
            
99
which can be used by third party developers as well. Full exports (see 
99
which can be used by third party developers as well. Full exports (see 
            
100
below).\""
100
below).\""
            
101
    }
101
    }
            
102
  ], 
102
  ], 
            
103
  "groups": [], 
103
  "groups": [], 
            
104
  "id": "43754a6e-47e2-4056-93a9-bf949b2c02c1", 
104
  "id": "43754a6e-47e2-4056-93a9-bf949b2c02c1", 
            
105
  "isopen": false, 
105
  "isopen": false, 
            
106
  "license_id": "", 
106
  "license_id": "", 
            
107
  "license_title": "", 
107
  "license_title": "", 
            
108
  "maintainer": "", 
108
  "maintainer": "", 
            
109
  "maintainer_email": "", 
109
  "maintainer_email": "", 
            
110
  "metadata_created": "2022-04-06T02:56:18.359485", 
110
  "metadata_created": "2022-04-06T02:56:18.359485", 
            
n
111
  "metadata_modified": "2022-04-06T02:56:18.359493", 
n
111
  "metadata_modified": "2022-04-06T02:56:32.427000", 
            
112
  "name": "obis-canada", 
112
  "name": "obis-canada", 
            
113
  "notes": "\u201cOBIS Canada\u201d is the Canadian regional OBIS node 
113
  "notes": "\u201cOBIS Canada\u201d is the Canadian regional OBIS node 
            
114
and along with the Ocean Tracking Network thematic OBIS node 
114
and along with the Ocean Tracking Network thematic OBIS node 
            
115
represents Canada\u2019s contribution to this global initiative. 
115
represents Canada\u2019s contribution to this global initiative. 
            
116
Fisheries and Oceans Canada supports OBIS by managing the OBIS Canada 
116
Fisheries and Oceans Canada supports OBIS by managing the OBIS Canada 
            
117
node and contributing datasets. OBIS Canada was recognized as a 
117
node and contributing datasets. OBIS Canada was recognized as a 
            
118
National Activity by the National Science Data Management Committee of 
118
National Activity by the National Science Data Management Committee of 
            
119
Fisheries and Oceans Canada in 2010.\r\n", 
119
Fisheries and Oceans Canada in 2010.\r\n", 
            
n
120
  "num_resources": 0, 
n
120
  "num_resources": 1, 
            
121
  "num_tags": 0, 
121
  "num_tags": 0, 
            
122
  "organization": {
122
  "organization": {
            
123
    "approval_status": "approved", 
123
    "approval_status": "approved", 
            
124
    "created": "2020-04-30T11:11:08.802657", 
124
    "created": "2020-04-30T11:11:08.802657", 
            
125
    "description": "Aerospace Information Research Institute (AIR) 
125
    "description": "Aerospace Information Research Institute (AIR) 
            
126
under the Chinese Academy of Sciences (CAS) was established in July 
126
under the Chinese Academy of Sciences (CAS) was established in July 
            
127
2017, following the approval for consolidation of three CAS 
127
2017, following the approval for consolidation of three CAS 
            
128
institutes: the Institute of Electronics (IECAS), the Institute of 
128
institutes: the Institute of Electronics (IECAS), the Institute of 
            
129
Remote Sensing and Digital Earth (RADI), and the Academy of 
129
Remote Sensing and Digital Earth (RADI), and the Academy of 
            
130
Opto-Electronics (AOE) at CAS President Board Meeting. The merger is 
130
Opto-Electronics (AOE) at CAS President Board Meeting. The merger is 
            
131
the outcome of CAS efforts towards reformation of its R&D system to 
131
the outcome of CAS efforts towards reformation of its R&D system to 
            
132
meet future R&D challenges and to better meet the national demands.", 
132
meet future R&D challenges and to better meet the national demands.", 
            
133
    "id": "c25dce84-97be-4153-8b90-d38f9ab73e5f", 
133
    "id": "c25dce84-97be-4153-8b90-d38f9ab73e5f", 
            
134
    "image_url": "2021-05-18-080509.992585AIRlogo.png", 
134
    "image_url": "2021-05-18-080509.992585AIRlogo.png", 
            
135
    "is_organization": true, 
135
    "is_organization": true, 
            
136
    "name": "air", 
136
    "name": "air", 
            
137
    "state": "active", 
137
    "state": "active", 
            
138
    "title": "Aerospace Information Research Institute, CAS", 
138
    "title": "Aerospace Information Research Institute, CAS", 
            
139
    "type": "organization"
139
    "type": "organization"
            
140
  }, 
140
  }, 
            
141
  "owner_org": "c25dce84-97be-4153-8b90-d38f9ab73e5f", 
141
  "owner_org": "c25dce84-97be-4153-8b90-d38f9ab73e5f", 
            
142
  "private": false, 
142
  "private": false, 
            
143
  "relationships_as_object": [], 
143
  "relationships_as_object": [], 
            
144
  "relationships_as_subject": [], 
144
  "relationships_as_subject": [], 
            
t
145
  "resources": [], 
t
145
  "resources": [
            
146
    {
            
147
      "cache_last_updated": null, 
            
148
      "cache_url": null, 
            
149
      "created": "2022-04-06T02:56:32.434103", 
            
150
      "datastore_active": false, 
            
151
      "description": "\u201cOBIS Canada\u201d is the Canadian regional 
            
152
OBIS node and along with the Ocean Tracking Network thematic OBIS node 
            
153
represents Canada\u2019s contribution to this global initiative. 
            
154
Fisheries and Oceans Canada supports OBIS by managing the OBIS Canada 
            
155
node and contributing datasets. OBIS Canada was recognized as a 
            
156
National Activity by the National Science Data Management Committee of 
            
157
Fisheries and Oceans Canada in 2010.\r\n", 
            
158
      "format": "", 
            
159
      "hash": "", 
            
160
      "id": "52bc23dc-ea50-439f-be53-ad72aa1b0e82", 
            
161
      "last_modified": null, 
            
162
      "metadata_modified": "2022-04-06T02:56:32.430432", 
            
163
      "mimetype": null, 
            
164
      "mimetype_inner": null, 
            
165
      "name": "OBIS Canada", 
            
166
      "package_id": "43754a6e-47e2-4056-93a9-bf949b2c02c1", 
            
167
      "position": 0, 
            
168
      "resource_type": null, 
            
169
      "size": null, 
            
170
      "state": "active", 
            
171
      "url": 
            
172
"https://obis.org/node/7dfb2d90-9317-434d-8d4e-64adf324579a", 
            
173
      "url_type": null
            
174
    }
            
175
  ], 
            
146
  "state": "draft", 
176
  "state": "draft", 
            
147
  "tags": [], 
177
  "tags": [], 
            
148
  "title": "OBIS Canada", 
178
  "title": "OBIS Canada", 
            
149
  "type": "dataset", 
179
  "type": "dataset", 
            
150
  "url": "https://obis.org/node/7dfb2d90-9317-434d-8d4e-64adf324579a", 
180
  "url": "https://obis.org/node/7dfb2d90-9317-434d-8d4e-64adf324579a", 
            
151
  "version": ""
181
  "version": ""
            
152
}
182
}