Changes

              
    

          
          
        
        

            
f
1
{
f
1
{
            
2
  "author": "", 
2
  "author": "", 
            
3
  "author_email": "", 
3
  "author_email": "", 
            
4
  "creator_user_id": "2e9fa41b-0394-4070-98d0-205f79d5738b", 
4
  "creator_user_id": "2e9fa41b-0394-4070-98d0-205f79d5738b", 
            
5
  "extras": [
5
  "extras": [
            
6
    {
6
    {
            
7
      "key": "Country", 
7
      "key": "Country", 
            
8
      "value": "Canada"
8
      "value": "Canada"
            
9
    }, 
9
    }, 
            
10
    {
10
    {
            
11
      "key": "Data Management", 
11
      "key": "Data Management", 
            
12
      "value": "\"Biodiversity data standards From the very beginning, 
12
      "value": "\"Biodiversity data standards From the very beginning, 
            
13
OBIS has championed the use international standards for biogeographic 
13
OBIS has championed the use international standards for biogeographic 
            
14
data. Without agreement on the application of standards and protocols, 
14
data. Without agreement on the application of standards and protocols, 
            
15
OBIS would not have been able to build a large central database. OBIS 
15
OBIS would not have been able to build a large central database. OBIS 
            
16
uses the following standards:  Darwin Core Ecological Metadata 
16
uses the following standards:  Darwin Core Ecological Metadata 
            
17
Language Darwin Core Archive and dataset structure  Data publication 
17
Language Darwin Core Archive and dataset structure  Data publication 
            
18
and sharing OBIS nodes can accept any data files from its data sources 
18
and sharing OBIS nodes can accept any data files from its data sources 
            
19
or data providers, and they publish these data on their OBIS nodes 
19
or data providers, and they publish these data on their OBIS nodes 
            
20
IPT, which are harvested by central OBIS. The Integrated Publishing 
20
IPT, which are harvested by central OBIS. The Integrated Publishing 
            
21
Toolkit (IPT) is developed and maintained by the Global Biodiversity 
21
Toolkit (IPT) is developed and maintained by the Global Biodiversity 
            
22
Information Facility (GBIF). GBIF maintains an IPT manual. See here 
22
Information Facility (GBIF). GBIF maintains an IPT manual. See here 
            
23
for specific OBIS instructions:  IPT  OBIS data quality control 
23
for specific OBIS instructions:  IPT  OBIS data quality control 
            
24
procedures OBIS ignores records that do not meet a number of 
24
procedures OBIS ignores records that do not meet a number of 
            
25
standards. For example, all species names need to be matched against 
25
standards. For example, all species names need to be matched against 
            
26
an authoritative taxonomic register, such as the World Register of 
26
an authoritative taxonomic register, such as the World Register of 
            
27
Marine Species. In addition, quality is checked against the OBIS 
27
Marine Species. In addition, quality is checked against the OBIS 
            
28
required fields as well as against any impossible values. OBIS checks, 
28
required fields as well as against any impossible values. OBIS checks, 
            
29
rejects and reports the data quality back to the OBIS nodes, but never 
29
rejects and reports the data quality back to the OBIS nodes, but never 
            
30
change records. The OBIS tier 2 nodes are responsible for the data 
30
change records. The OBIS tier 2 nodes are responsible for the data 
            
31
quality and communicate errors back to the data providers. A number of 
31
quality and communicate errors back to the data providers. A number of 
            
32
QC tools are developed to help data providers and OBIS nodes:  QC tool 
32
QC tools are developed to help data providers and OBIS nodes:  QC tool 
            
33
for species names QC tool for geography and data format\""
33
for species names QC tool for geography and data format\""
            
34
    }, 
34
    }, 
            
35
    {
35
    {
            
36
      "key": "Data Policy", 
36
      "key": "Data Policy", 
            
37
      "value": "\"Guidelines on the sharing and use of data in OBIS 
37
      "value": "\"Guidelines on the sharing and use of data in OBIS 
            
38
Adopted at SG-OBIS-IV (Feb 2015) and IODE-XXIII (March 2015).  The 
38
Adopted at SG-OBIS-IV (Feb 2015) and IODE-XXIII (March 2015).  The 
            
39
OBIS data policy is based on the principles of timely, free and 
39
OBIS data policy is based on the principles of timely, free and 
            
40
unrestricted access to biodiversity data for the benefit of science 
40
unrestricted access to biodiversity data for the benefit of science 
            
41
and society, as defined in the:  IOC data exchange policy IOC 
41
and society, as defined in the:  IOC data exchange policy IOC 
            
42
guidelines on transfer of marine technology IODE objectives OBIS 
42
guidelines on transfer of marine technology IODE objectives OBIS 
            
43
vision and mission Unless data are collected through activities funded 
43
vision and mission Unless data are collected through activities funded 
            
44
by IOC/IODE, neither UNESCO, IOC, IODE, the OBIS Secretariat, nor its 
44
by IOC/IODE, neither UNESCO, IOC, IODE, the OBIS Secretariat, nor its 
            
45
employees or contractors, own the data in OBIS and they take no 
45
employees or contractors, own the data in OBIS and they take no 
            
46
responsibility for the quality of data or products based on OBIS, or 
46
responsibility for the quality of data or products based on OBIS, or 
            
47
the use or misuse that people may make of them nor can it control or 
47
the use or misuse that people may make of them nor can it control or 
            
48
limit the use of any data or products accessible through its website, 
48
limit the use of any data or products accessible through its website, 
            
49
other than through the use of a published Data Sharing and Use Terms 
49
other than through the use of a published Data Sharing and Use Terms 
            
50
and Conditions.  Data sharing agreement The data providers retain all 
50
and Conditions.  Data sharing agreement The data providers retain all 
            
51
rights and responsibilities associated with the data they make 
51
rights and responsibilities associated with the data they make 
            
52
available to OBIS via the OBIS nodes. The OBIS nodes warrant that they 
52
available to OBIS via the OBIS nodes. The OBIS nodes warrant that they 
            
53
have made the necessary agreements with the original data providers 
53
have made the necessary agreements with the original data providers 
            
54
that it can make the data available to OBIS data under the following 
54
that it can make the data available to OBIS data under the following 
            
55
Creative Commons licenses:  CC-0 CC-BY CC-BY-NC CC-0 is the preferred 
55
Creative Commons licenses:  CC-0 CC-BY CC-BY-NC CC-0 is the preferred 
            
56
one and CC-BY-NC the least preferred.  The data providers are 
56
one and CC-BY-NC the least preferred.  The data providers are 
            
57
responsible for the completeness of the data and metadata profiles. 
57
responsible for the completeness of the data and metadata profiles. 
            
58
When data is made available to OBIS, OBIS is granted permission to:  
58
When data is made available to OBIS, OBIS is granted permission to:  
            
59
Distribute the data via its data and information portal Build an 
59
Distribute the data via its data and information portal Build an 
            
60
integrated database, use the data for data quality control purposes, 
60
integrated database, use the data for data quality control purposes, 
            
61
complement the data with other data such as climate variables and 
61
complement the data with other data such as climate variables and 
            
62
build value-added information products and services for science and 
62
build value-added information products and services for science and 
            
63
decision-making Serve the data to other similar open-access networks 
63
decision-making Serve the data to other similar open-access networks 
            
64
such as GBIF in compliance with the terms and conditions for use set 
64
such as GBIF in compliance with the terms and conditions for use set 
            
65
by the data providers. In pursuance of copyright compliance, OBIS 
65
by the data providers. In pursuance of copyright compliance, OBIS 
            
66
endeavours to secure permission from rights holders to ingest their 
66
endeavours to secure permission from rights holders to ingest their 
            
67
datasets. In the event that the inclusion of a dataset in OBIS is 
67
datasets. In the event that the inclusion of a dataset in OBIS is 
            
68
challenged on the basis of copyright infringement, OBIS will follow a 
68
challenged on the basis of copyright infringement, OBIS will follow a 
            
69
take-down policy until there is resolution.  Data use agreement The 
69
take-down policy until there is resolution.  Data use agreement The 
            
70
data in OBIS are freely available to everyone, following the 
70
data in OBIS are freely available to everyone, following the 
            
71
principles of equitable access and benefit sharing and supporting 
71
principles of equitable access and benefit sharing and supporting 
            
72
capacity development and participation of all IOC Member States in 
72
capacity development and participation of all IOC Member States in 
            
73
global programmes. However, data users are expected to give 
73
global programmes. However, data users are expected to give 
            
74
attribution to the data providers (see Citations) and the use of data 
74
attribution to the data providers (see Citations) and the use of data 
            
75
from OBIS should happen in the light of fair use, i.e.:  Recognize 
75
from OBIS should happen in the light of fair use, i.e.:  Recognize 
            
76
that the OBIS portal holds the master copy of the integrated database 
76
that the OBIS portal holds the master copy of the integrated database 
            
77
and hence users should refrain from online redistribution of the OBIS 
77
and hence users should refrain from online redistribution of the OBIS 
            
78
database. Because the OBIS database is updated regularly (every so 
78
database. Because the OBIS database is updated regularly (every so 
            
79
months) with new datasets and revisions of existing datasets, copies 
79
months) with new datasets and revisions of existing datasets, copies 
            
80
of the OBIS database will become out of date quickly. If you wish to 
80
of the OBIS database will become out of date quickly. If you wish to 
            
81
build access web services on top of OBIS, please contact the OBIS 
81
build access web services on top of OBIS, please contact the OBIS 
            
82
secretariat. Respect the data providers, and provide helpful feedback 
82
secretariat. Respect the data providers, and provide helpful feedback 
            
83
on data quality. In the case you are a custodian of biogeographic data 
83
on data quality. In the case you are a custodian of biogeographic data 
            
84
yourself you should take action to also publish these data through 
84
yourself you should take action to also publish these data through 
            
85
OBIS. Consider sponsoring or partnering with OBIS and its OBIS nodes 
85
OBIS. Consider sponsoring or partnering with OBIS and its OBIS nodes 
            
86
in grant proposal writing. Creating a global database like OBIS cannot 
86
in grant proposal writing. Creating a global database like OBIS cannot 
            
87
happen without the, often voluntary, contribution of many scientists 
87
happen without the, often voluntary, contribution of many scientists 
            
88
and data managers all over the world. Several activities, such as the 
88
and data managers all over the world. Several activities, such as the 
            
89
coordination, data aggregation, quality control, database and website 
89
coordination, data aggregation, quality control, database and website 
            
90
maintenance require resources including manpower at national and 
90
maintenance require resources including manpower at national and 
            
91
international level. A list of sponsors can be found here\""
91
international level. A list of sponsors can be found here\""
            
92
    }, 
92
    }, 
            
93
    {
93
    {
            
94
      "key": "Data Sharing Principle", 
94
      "key": "Data Sharing Principle", 
            
95
      "value": "\"OBIS harvests occurrence records from thousands of 
95
      "value": "\"OBIS harvests occurrence records from thousands of 
            
96
datasets and makes them available as a single integrated dataset. 
96
datasets and makes them available as a single integrated dataset. 
            
97
There are several ways to access OBIS data:  The mapper allows users 
97
There are several ways to access OBIS data:  The mapper allows users 
            
98
to visualize and inspect subsets of OBIS data. A variety of filters 
98
to visualize and inspect subsets of OBIS data. A variety of filters 
            
99
(taxonomic, geographic, time, data quality) is available and multiple 
99
(taxonomic, geographic, time, data quality) is available and multiple 
            
100
layers can be combined in a single view. Layers can be downloaded as 
100
layers can be combined in a single view. Layers can be downloaded as 
            
101
CSV files. Our R package provides direct access to the OBIS database 
101
CSV files. Our R package provides direct access to the OBIS database 
            
102
from R. Both the mapper and the R package are based on the OBIS API 
102
from R. Both the mapper and the R package are based on the OBIS API 
            
103
which can be used by third party developers as well. Full exports (see 
103
which can be used by third party developers as well. Full exports (see 
            
104
below).\""
104
below).\""
            
n
n
105
    }, 
            
106
    {
            
107
      "key": "Database Level", 
            
108
      "value": "National"
            
109
    }, 
            
110
    {
            
111
      "key": "FIAR", 
            
112
      "value": "No"
            
113
    }, 
            
114
    {
            
115
      "key": "Host Institute", 
            
116
      "value": "Bedford Institute of Oceanography"
            
117
    }, 
            
118
    {
            
119
      "key": "Opening Degree", 
            
120
      "value": "Open"
            
121
    }, 
            
122
    {
            
123
      "key": "Organizer", 
            
124
      "value": "Bedford Institute of Oceanography"
            
125
    }, 
            
126
    {
            
127
      "key": "Region", 
            
128
      "value": "Arctic"
            
129
    }, 
            
130
    {
            
131
      "key": "Source of Data Policy", 
            
132
      "value": "Own"
            
133
    }, 
            
134
    {
            
135
      "key": "Theme", 
            
136
      "value": "Ecology"
            
105
    }
137
    }
            
106
  ], 
138
  ], 
            
107
  "groups": [
139
  "groups": [
            
108
    {
140
    {
            
109
      "description": "Inventory of Database for Earth Three Poles", 
141
      "description": "Inventory of Database for Earth Three Poles", 
            
110
      "display_name": "An Inventory of Database for Earth Three 
142
      "display_name": "An Inventory of Database for Earth Three 
            
111
Poles", 
143
Poles", 
            
112
      "id": "543d60c4-2ba5-4474-b3d2-47a5cd109ce8", 
144
      "id": "543d60c4-2ba5-4474-b3d2-47a5cd109ce8", 
            
113
      "image_display_url": 
145
      "image_display_url": 
            
114
.142.79/uploads/group/2021-05-18-053212.318529inventurydatabase1.jpg", 
146
.142.79/uploads/group/2021-05-18-053212.318529inventurydatabase1.jpg", 
            
115
      "name": "inventury-of-database-for-earth-three-poles", 
147
      "name": "inventury-of-database-for-earth-three-poles", 
            
116
      "title": "An Inventory of Database for Earth Three Poles"
148
      "title": "An Inventory of Database for Earth Three Poles"
            
117
    }
149
    }
            
118
  ], 
150
  ], 
            
119
  "id": "43754a6e-47e2-4056-93a9-bf949b2c02c1", 
151
  "id": "43754a6e-47e2-4056-93a9-bf949b2c02c1", 
            
120
  "isopen": false, 
152
  "isopen": false, 
            
121
  "license_id": "", 
153
  "license_id": "", 
            
122
  "license_title": "", 
154
  "license_title": "", 
            
123
  "maintainer": "", 
155
  "maintainer": "", 
            
124
  "maintainer_email": "", 
156
  "maintainer_email": "", 
            
125
  "metadata_created": "2022-04-06T02:56:18.359485", 
157
  "metadata_created": "2022-04-06T02:56:18.359485", 
            
t
126
  "metadata_modified": "2022-04-08T10:25:04.513236", 
t
158
  "metadata_modified": "2022-04-12T07:57:50.754156", 
            
127
  "name": "obis-canada", 
159
  "name": "obis-canada", 
            
128
  "notes": "\u201cOBIS Canada\u201d is the Canadian regional OBIS node 
160
  "notes": "\u201cOBIS Canada\u201d is the Canadian regional OBIS node 
            
129
and along with the Ocean Tracking Network thematic OBIS node 
161
and along with the Ocean Tracking Network thematic OBIS node 
            
130
represents Canada\u2019s contribution to this global initiative. 
162
represents Canada\u2019s contribution to this global initiative. 
            
131
Fisheries and Oceans Canada supports OBIS by managing the OBIS Canada 
163
Fisheries and Oceans Canada supports OBIS by managing the OBIS Canada 
            
132
node and contributing datasets. OBIS Canada was recognized as a 
164
node and contributing datasets. OBIS Canada was recognized as a 
            
133
National Activity by the National Science Data Management Committee of 
165
National Activity by the National Science Data Management Committee of 
            
134
Fisheries and Oceans Canada in 2010.\r\n", 
166
Fisheries and Oceans Canada in 2010.\r\n", 
            
135
  "num_resources": 1, 
167
  "num_resources": 1, 
            
136
  "num_tags": 0, 
168
  "num_tags": 0, 
            
137
  "organization": {
169
  "organization": {
            
138
    "approval_status": "approved", 
170
    "approval_status": "approved", 
            
139
    "created": "2020-04-30T11:11:08.802657", 
171
    "created": "2020-04-30T11:11:08.802657", 
            
140
    "description": "Aerospace Information Research Institute (AIR) 
172
    "description": "Aerospace Information Research Institute (AIR) 
            
141
under the Chinese Academy of Sciences (CAS) was established in July 
173
under the Chinese Academy of Sciences (CAS) was established in July 
            
142
2017, following the approval for consolidation of three CAS 
174
2017, following the approval for consolidation of three CAS 
            
143
institutes: the Institute of Electronics (IECAS), the Institute of 
175
institutes: the Institute of Electronics (IECAS), the Institute of 
            
144
Remote Sensing and Digital Earth (RADI), and the Academy of 
176
Remote Sensing and Digital Earth (RADI), and the Academy of 
            
145
Opto-Electronics (AOE) at CAS President Board Meeting. The merger is 
177
Opto-Electronics (AOE) at CAS President Board Meeting. The merger is 
            
146
the outcome of CAS efforts towards reformation of its R&D system to 
178
the outcome of CAS efforts towards reformation of its R&D system to 
            
147
meet future R&D challenges and to better meet the national demands.", 
179
meet future R&D challenges and to better meet the national demands.", 
            
148
    "id": "c25dce84-97be-4153-8b90-d38f9ab73e5f", 
180
    "id": "c25dce84-97be-4153-8b90-d38f9ab73e5f", 
            
149
    "image_url": "2021-05-18-080509.992585AIRlogo.png", 
181
    "image_url": "2021-05-18-080509.992585AIRlogo.png", 
            
150
    "is_organization": true, 
182
    "is_organization": true, 
            
151
    "name": "air", 
183
    "name": "air", 
            
152
    "state": "active", 
184
    "state": "active", 
            
153
    "title": "Aerospace Information Research Institute, CAS", 
185
    "title": "Aerospace Information Research Institute, CAS", 
            
154
    "type": "organization"
186
    "type": "organization"
            
155
  }, 
187
  }, 
            
156
  "owner_org": "c25dce84-97be-4153-8b90-d38f9ab73e5f", 
188
  "owner_org": "c25dce84-97be-4153-8b90-d38f9ab73e5f", 
            
157
  "private": false, 
189
  "private": false, 
            
158
  "relationships_as_object": [], 
190
  "relationships_as_object": [], 
            
159
  "relationships_as_subject": [], 
191
  "relationships_as_subject": [], 
            
160
  "resources": [
192
  "resources": [
            
161
    {
193
    {
            
162
      "cache_last_updated": null, 
194
      "cache_last_updated": null, 
            
163
      "cache_url": null, 
195
      "cache_url": null, 
            
164
      "created": "2022-04-06T02:56:32.434103", 
196
      "created": "2022-04-06T02:56:32.434103", 
            
165
      "datastore_active": false, 
197
      "datastore_active": false, 
            
166
      "description": "\u201cOBIS Canada\u201d is the Canadian regional 
198
      "description": "\u201cOBIS Canada\u201d is the Canadian regional 
            
167
OBIS node and along with the Ocean Tracking Network thematic OBIS node 
199
OBIS node and along with the Ocean Tracking Network thematic OBIS node 
            
168
represents Canada\u2019s contribution to this global initiative. 
200
represents Canada\u2019s contribution to this global initiative. 
            
169
Fisheries and Oceans Canada supports OBIS by managing the OBIS Canada 
201
Fisheries and Oceans Canada supports OBIS by managing the OBIS Canada 
            
170
node and contributing datasets. OBIS Canada was recognized as a 
202
node and contributing datasets. OBIS Canada was recognized as a 
            
171
National Activity by the National Science Data Management Committee of 
203
National Activity by the National Science Data Management Committee of 
            
172
Fisheries and Oceans Canada in 2010.\r\n", 
204
Fisheries and Oceans Canada in 2010.\r\n", 
            
173
      "format": "", 
205
      "format": "", 
            
174
      "hash": "", 
206
      "hash": "", 
            
175
      "id": "52bc23dc-ea50-439f-be53-ad72aa1b0e82", 
207
      "id": "52bc23dc-ea50-439f-be53-ad72aa1b0e82", 
            
176
      "last_modified": null, 
208
      "last_modified": null, 
            
177
      "metadata_modified": "2022-04-06T02:56:32.596699", 
209
      "metadata_modified": "2022-04-06T02:56:32.596699", 
            
178
      "mimetype": null, 
210
      "mimetype": null, 
            
179
      "mimetype_inner": null, 
211
      "mimetype_inner": null, 
            
180
      "name": "OBIS Canada", 
212
      "name": "OBIS Canada", 
            
181
      "package_id": "43754a6e-47e2-4056-93a9-bf949b2c02c1", 
213
      "package_id": "43754a6e-47e2-4056-93a9-bf949b2c02c1", 
            
182
      "position": 0, 
214
      "position": 0, 
            
183
      "resource_type": null, 
215
      "resource_type": null, 
            
184
      "size": null, 
216
      "size": null, 
            
185
      "state": "active", 
217
      "state": "active", 
            
186
      "url": 
218
      "url": 
            
187
"https://obis.org/node/7dfb2d90-9317-434d-8d4e-64adf324579a", 
219
"https://obis.org/node/7dfb2d90-9317-434d-8d4e-64adf324579a", 
            
188
      "url_type": null
220
      "url_type": null
            
189
    }
221
    }
            
190
  ], 
222
  ], 
            
191
  "state": "active", 
223
  "state": "active", 
            
192
  "tags": [], 
224
  "tags": [], 
            
193
  "title": "OBIS Canada", 
225
  "title": "OBIS Canada", 
            
194
  "type": "dataset", 
226
  "type": "dataset", 
            
195
  "url": "https://obis.org/node/7dfb2d90-9317-434d-8d4e-64adf324579a", 
227
  "url": "https://obis.org/node/7dfb2d90-9317-434d-8d4e-64adf324579a", 
            
196
  "version": ""
228
  "version": ""
            
197
}
229
}